TimeMachine が遅いのは
１）アンチウイルスソフトがうごいているから
２）Spotlight の検索範囲が大きいから
ということのようで、１）はサーバ機で、定時にアンチウイルスソフトを止めてからTimeMachineを動かすなど不可能じゃないけど面倒なので、まず２）をデフォルトから変更してみた。
TimeMachineEditor で一日午前３時だけバックアップするように設定してある。Spotlightの変更前の本日の朝３時からのバックアップは；

15/08/27 3:00:01: Starting standard backup
15/08/27 3:00:01: Backing up to: /Volumes/TimeMachine/Backups.backupdb
15/08/27 4:01:08: Backup completed successfully.

というわけで１時間かかっている。
Spotlightの検索範囲は、デフォルトではすべてにチェックがついているけど。これを

と、３つだけにした。さらに、バックアップHDDは検索範囲外とした。

どうなるだろ。10.7 ではTimeMachineの宛先HDDをここで指定しては行けないという記事がある。
HDDのアクアス権修復、CCCのバックアップ先HDDの修復とアクセセス権の修復、TimeMachineのHDDの修復とアクセセス権の修復を実施した。
これで今晩はどうなるか、明日早朝チェックしてみる。
[ 追記 ] 次のバックアップは２０分に縮小した。Spotlight検索範囲を減らすというのは効果があった。２０分だったら、ま、いっか。次の日は１８分だった。
サーバ機なので、ファイルの検索なんかやらないということで、Spotlightを止めちゃうことが考えられる。
Spotlightの動作停止は

sudo launchctl unload -w /System/Library/LaunchDaemons/com.apple.metadata.mds.plist

再開は

sudo launchctl load -w /System/Library/LaunchDaemons/com.apple.metadata.mds.plist

らしい。まだためしていない。